A princípio a senha do usuário administrador do banco de dados (root) não está configurada, portanto não se faz necessária a digitação da senha. Porém, caso deseje configurar uma senha para este usuário, basta comandar no sinal de prontidão do Linux:
Exemplo 3-24. Configurando a senha do usuário root do MySQL
[desenv@srvlnx] mysql -u root mysql> use mysql; mysql> update user set password=PASSWORD('nova_senha') where user='root'; mysql> flush privileges;
Substitua nova_senha pela senha que deseje configurar.
Não confunda o usuário root de seu sistema operacional Linux com o usuário root do MySQL. Apesar de terem o mesmo nome, é possível que uma pessoa seja root do MySQL e não seja root do Linux, e vice-versa.